Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gja5Q01231 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms