Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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SgcdP82347 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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