Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Irx1P81068 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Irx1P81068 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Irx1P81068 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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