Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab11bP46638 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms