Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Apoc1P34928 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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