Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms