Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms