Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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