Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Brpf3B2KF05 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms