Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Exosc7Q9D0M0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms