Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cabp4Q8VHC5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms