Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp44Q8C2S0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp44Q8C2S0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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