Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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