Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms