Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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