Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Lrriq3Q14DL3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lrriq3Q14DL3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lrriq3Q14DL3 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lrriq3Q14DL3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lrriq3Q14DL3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lrriq3Q14DL3 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lrriq3Q14DL3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrriq3Q14DL3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms