Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RptnP97347 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RptnP97347 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RptnP97347 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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