Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms