Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms