Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Saa4P31532 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Saa4P31532 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms