Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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