Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcl9P18340 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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