Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tnp1P10856 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms