Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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