Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr29B1ARI9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr29B1ARI9 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr29B1ARI9 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr29B1ARI9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prr29B1ARI9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prr29B1ARI9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr29B1ARI9 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms