Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx20Q9D2Y5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms