Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clip4Q8CI96 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clip4Q8CI96 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Clip4Q8CI96 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clip4Q8CI96 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clip4Q8CI96 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clip4Q8CI96 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clip4Q8CI96 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms