Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg4aQ8C9S8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4aQ8C9S8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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