Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r223Q5SSA0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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