Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rtl5Q5DTT4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rtl5Q5DTT4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rtl5Q5DTT4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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