Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ly6g5b-201ENSMUST00000062657 1046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Enpp3-203ENSMUST00000218044 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Eif3g-201ENSMUST00000004206 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC091683.2-201ENSMUST00000222996 1185 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm15841-201ENSMUST00000160540 517 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms