Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms