Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms