Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme1P97371 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms