Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms