Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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BC024978J3QPC3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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BC024978J3QPC3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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BC024978J3QPC3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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