Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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