Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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