Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm5478D3Z6R0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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