Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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