Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cdk9Q99J95 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cdk9Q99J95 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk9Q99J95 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cdk9Q99J95 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cdk9Q99J95 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cdk9Q99J95 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cdk9Q99J95 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cdk9Q99J95 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cdk9Q99J95 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk9Q99J95 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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