Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4M5

Commd1, COMM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd1Q8K4M5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Commd1Q8K4M5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms