Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Dsg1bQ7TSF1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Dsg1bQ7TSF1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Dsg1bQ7TSF1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Dsg1bQ7TSF1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Dsg1bQ7TSF1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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