Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms