Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms