Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
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