Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Treml4Q3LRV9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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