Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
NrepQ07475 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms