Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Irx3P81067 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irx3P81067 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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