Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HBBP68871 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms